Деревня Непейцино расположена в 21 км от города Клин, в северо-восточном направлении
Относится к сельскому поселению Воронинское
На северо-западе к деревне примыкает д. Крупенино, на севере д. Кондырино. Ближайшие крупнейшие населенные пункты: д. Слобода (4 км на запад), п. Раздолье (8 км на юго-запад). Рядом находятся: деревни Ватолино (2 км на запад), Терехова (2 км на запад), Борки (2 км на восток), Еросимово (3 км на юго-запад), Подтеребово (3 км на северо-запад)
По данным последней переписи в деревне зарегистрированы 5 жителей (2 мужчины, 3 женщины)
Высота над уровнем моря 131 м.
Координаты: 56°29΄17˝С.Ш. 36°56΄27˝В.Д.
Код ОКТМО: 46621410226
Код ОКАТО: 46221846012
Код КЛАДР: 5001100014100