Деревня Шишаиха расположена в 17 км от города Истра, в западном-северо-западном направлении
Относится к сельскому поселению Ядроминское
Ближайшие крупнейшие населенные пункты: деревни Савельево (2 км на северо-запад), Курово (3 км на северо-запад), п. Курсаково (5 км на юго-запад). Рядом находятся: деревни Долево (1 км на запад), Горки (1 км на северо-запад), Марково-Курсаково (2 км на юг), Покоево (3 км на север), Филатово (3 км на юго-восток)
По состоянию на 2010 год в деревне зарегистрированы 12 жителей (9 мужчин, 3 женщины)
Высота над уровнем моря 194 м.
Координаты: 55°59΄50˝С.Ш. 36°38΄1˝В.Д.
Код ОКТМО: 46618443231
Код ОКАТО: 46218843016
Код КЛАДР: 5000900072600