Деревня Малыгино расположена в 19 км от города Дмитров, в западном направлении
Относится к сельскому поселению Синьковское
На севере к деревне примыкает д. Селиваново. Ближайшие крупнейшие населенные пункты: п. Автополигон (6 км на восток), с. Семеновское (6 км на запад), д. Савельево (6 км на северо-восток). Рядом находятся: деревни Эскино (0 км на юго-запад), Подсосенье (1 км на север), Мотовилово (2 км на северо-запад), Тютьково (2 км на север), с. Турбичево (2 км на запад)
По данным переписи 2010 года в деревне зарегистрированы 0 жителей
Высота над уровнем моря 198 м.
Координаты: 56°19΄47˝С.Ш. 37°13΄54˝В.Д.
Код ОКТМО: 46608461261
Код ОКАТО: 46208839011
Код КЛАДР: 5000500023100