Когда-то Чистый пруд назывался совсем наоборот Поганым. В XVII веке в этом районе находилась скотобойня, и отходы от нее сливались в воду. В начале XVIII века князь А. Д. Меньшиков выкупает эту землю и дом неподалеку. По его приказу пруд очищают, а торговлю мясом сворачивают. Так водоем получает свое нынешнее название.
Затем Меньшикова отправляют в ссылку, имения и земли переходят к другим князьям. В 1783 году в его доме открывают Московский почтамт. После пожара 1812 года пруд был вновь очищен, на его берегах построили две гостиницы. Одна из них, рядом с Покровскими воротами, сохранилась до наших дней.
Прогуливаясь вдоль Чистых прудов, трудно не заметить церковь Архангела Гавриила. Ее построили во дворе дома Меньшикова на Мясницкой. Князь хотел, чтобы выстроенный им храм, был выше колокольни Ивана Великого. Для этого на его верхушке был построен деревянный шатер, увенчанный крестом. Так появилось второе название церкви Меньшикова башня. На ней были установлены 50 колоколов и часы с боем, доставленные из Лондона. В полдень они исполняли колокольную музыку.
В 1918 году на Чистопрудном бульваре ставят памятник идеологу русского анархизма М. А. Бакунину, но спустя несколько лет его сносят. В 1959 году здесь появляется монумент А. C. Грибоедова (писатель жил на Мясницкой улице). В 2006 году на Чистых прудах был установлен памятник казахскому поэту Абаю Кунанбаеву. Он перевел на казахский язык порядка 50 произведений известных русских писателей.
На Чистопрудном бульваре также сохранились особняки XVIII, XIX и начала XX века.
