Деревня Якшино расположена в 17 км от города Серпухов, в юго-юго-восточном направлении
Относится к сельскому поселению Липицкое
Ближайшие крупнейшие населенные пункты: с. Липицы (6 км на север), г. Пущино (6 км на северо-восток), д. Большое Грызлово (7 км на восток). Рядом находятся: деревни Зайцево (2 км на северо-восток), Глазово-2 (2 км на юго-восток), Шепилово (3 км на север), Рогово (4 км на юго-восток)
По данным переписи 2010 года в деревне зарегистрированы 39 жителей (19 мужчин, 20 женщин)
Высота над уровнем моря 204 м.
Координаты: 54°47΄25˝С.Ш. 37°31΄13˝В.Д.
Код ОКТМО: 46651422281
Код ОКАТО: 46251822015
Код КЛАДР: 5003200016900