Деревня Агарино расположена в 26 км от города Серпухов, в юго-восточном направлении
Относится к сельскому поселению Липицкое
Ближайшие крупнейшие населенные пункты: деревни Большая Городня (4 км на запад), Большое Грызлово (7 км на север). Рядом находятся: деревни Каргашино (1 км на северо-восток), Дубачино (1 км на северо-запад), Федотовка (2 км на северо-восток), Трухачево (3 км на север), Малое Грызлово (3 км на северо-восток)
По данным последней переписи в деревне зарегистрированы 5 жителей (2 мужчины, 3 женщины)
Высота над уровнем моря 211 м.
Координаты: 54°44΄16˝С.Ш. 37°39΄17˝В.Д.
Код ОКТМО: 46651422106
Код ОКАТО: 46251804002
Код КЛАДР: 5003200001700